红色原鸡和中国家鸡遗传多样性及亲缘关系

《中国科学:C辑》 包文斌[1];陈国宏[1];李碧春[1];吴信生[1];束婧婷[1];吴圣龙[1];徐琪[1];Steffen Weigend[2]
摘要:
对红色原鸡(Gallus gallus)和中国家鸡(Gallus domesticus)之间的遗传多样性和亲缘关系进行系统分析,可以为中国家鸡的起源进化、种质资源保护以及科学开发利用等研究提供理论依据,但迄今尚未见用微卫星标记进行分析比较的公开报道.本研究利用29对微卫星引物对红色原鸡Gallus gallus spadiceus亚种和Gallus gallus gallus亚种以及14个中国家鸡品种的568只个体进行扫描,共检测到286个等位基因,平均值为9.86±6.36;所有群体的期望杂合度为0.6708±0.0251,皖南三黄鸡的期望杂合度最高(0.6442),固始鸡的最低(0.4532).单个位点偏离Hardy-Weinberg平衡的群体数从0-7不等.整个群体平均遗传分化为17.9%(P〈0.001),约有16.7%的遗传变异源自群体间的差异,所有的位点都极显著地贡献于这一结果(P〈0.001);杂合子缺失的水平很高,为0.015(P〈0.01),有8个位点显示显著的杂合子缺失.群体间的Reynolds’遗传距离从0.036(萧山鸡-鹿苑鸡)~0.371(泰国红色原鸡-河南斗鸡)不等,而Nm值变异范围为从0.583(泰国红色原鸡-河南斗鸡)~5.833(萧山鸡鹿苑鸡).NJ系统发生树中,鹿苑鸡、萧山鸡、北京油鸡、河南斗鸡、淮南麻黄鸡、狼山鸡等重体型的鸡种首先形成一大类;鹿苑鸡与萧山鸡以及茶花鸡与藏鸡有着较近的遗传关系;茶花鸡和藏鸡与两个红色原鸡亚种亲缘关系较近,中国红色原鸡Gallus gallus spadiceus亚种与所有中国家鸡品种的亲缘关系比泰国红色原鸡Gallus gallus gallus亚种要近.结果表明:29个微卫星位点均具有较高的多态性,红色原鸡和中国家鸡群体间存在着极显著的遗传分化;中国家鸡和红色原鸡两个亚种的亲缘关系从近到远的排序是:进化型品种-原始型品种(茶花鸡与藏鸡)-中国红色原鸡亚种(Gallus gallus spadiceus)-
红色原鸡(Gallus , gallus) , 家鸡(Gallus , domesticus) , 微卫星 , 遗传多样性 , 亲缘关系
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