基因组原位杂交鉴定牛筋草AA基因组在穇子染色体上的分布及探针长度优化方法

《热带亚热带植物学报》 姜斌[1,2];刘利勤[3];胡晓颖[1];刘青[1]
摘要:
采用基因组原位杂交(Genomic in situ hybridization,GISH)方法研究了牛筋草(Eleusine indica)AA基因组在穆子(E.coracana_染色体上的分布,并探讨了AA、BB基因组的同源关系。用超声波破碎法进行预剪切,以缺口平移法标记的牛筋草总DNA为探针,BB基因组的Efloccifolia(Forssk.)Spreng.总DNA为封阻,与AABB基因组穆子的中期染色体进行杂交。结果表明,牛筋草AA基因组分布在穆子的18条染色体上。不加封阻或加过量封阻均不能鉴别AA基因组,说明AA和BB基因组间的分化程度不大,双方共享的重复序列较多。牛筋草与Efloccifolia总DNA分别用超声波破碎2min和3min后,可得到峰值为300~750bp的DNA片段,这说明不同物种的超声波破碎时间需要调整,以获得合适长度的探针。
AA基因组 , 穇子 , 基因组原位杂交 , 剪切方法
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