中国对虾线粒体16SrRNA基因序列分析

《中国水产科学》 高天翔[1];李健[2];王清印[3];刘进贤[1]
摘要:
中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)是我国海洋渔业重要的经济虾种之一.本研究以相应引物对野生群体和人工培育第1代、第4代、第5代、第6代群体(CP1、CP4、CP5、CP6)的各2个个体的线粒体16S rRNA基因片段进行了PCR扩增和序列测定分析.分析结果表明,测得的16S rRNA基因片段长为520 bp,10个中国对虾个体间无碱基差异,其A、T、G、C 含量分别为171 bp (32.88%)、176 bp (33.85%)、104 bp (20.00%)、69 bp (13.27%),AT含量明显高于GC含量.利用其中长度为413 bp的同源序列,以环斑鼓虾(Alpheus armillatus)为外群探讨了对虾科(Penaeidae)中的对虾属、美对虾属、明对虾属、囊对虾属和滨对虾属5个属(Penaeus,Farfantepenaeus,Fenneropenaeus,Marsupenaeus, Litopenaeus)12种对虾间的系统关系.以NJ法构建的分子系统树显示可将以上12种虾类分为两个大群:中国对虾和斑节对虾先聚到一起后与日本对虾聚成一大群;美对虾属、滨对虾属个体各聚成1支后聚成一大群,最后与中国对虾等聚到一起.同时可见,小褐美对虾(F. subtilis)与保罗美对虾(F. paulensis)、南方滨对虾(L. schmitti)与白滨对虾(L. setiferus)种间的亲缘关系较近.
中国对虾 , 线粒体 , 16SrRNA , 基因 , 序列分析 , 亲缘关系 , 野生群体 , 人工培育 , 对虾科
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